17 绝海的侦探
薄雾笼罩的京都，一起攸关日本国家安全的大事件即将发生。一艘疑似装载爆炸物的可疑船只靠近舞鹤湾。通过对船上相关数据和零部件的勘察判明，该船很大可能来自海外。此消息一出，立刻引起全日本上下的恐慌。就在同一天，江户川柯南、毛利小五郎、毛利兰以及少年侦探团的各位一同观摩海上自卫队组织的对空作战演习，他们史无前例地登上了宙斯盾舰穗高号，与全国各地聚集来的孩子们一起，被装备了电子武装的高科技宙斯盾舰带来的巨大魄力所震撼。谁知演习中突发意外，原本虚拟的作战瞬间变成真枪实弹的杀戮。不久，海面上漂浮着的失去左臂的自卫队队员一等海尉笹浦洋介遗体被发现。种种不安与猜测在小兰和少年侦探们的心中蔓延。另一方面，海上自卫队迅速冷静地稳定事态，但始终不能探明敌人的真实身份和他的目标。就在此时，宙斯盾舰上发现了遇害队员的左臂，其配戴的手表指针停止在上午5:30。接二连三的异常事件，迫使大阪府警乘坐直升机赶来，与京都当地的同侪协作展开调查。在此期间，神秘的女性自卫队员藤井七海也登上了宙斯盾舰。柯南通过随身携带的追踪眼镜、新道具卫星电话手表等装备与灰原哀、阿笠博士取得联系，此外更得到服部平次和远山和叶的协助。最强侦探团全方位通力合作，终于发现了这一系列事件背后的始作俑者——现已秘密潜入军舰内的某国间谍“X”。在此期间，平次和小兰等人的生命相继受到威胁。X到底有何目的?他的真实身份是什么?自卫队员的左臂以及藤井七海的背后又隐藏怎样的秘密?关系到全日本生死存亡的巨大阴谋，此刻正有条不紊地展开。柯南将于与看不见的敌方间谍进行谍报战，面临危浪绝海的紧急任务。此次柯南能否再次守护朋友，协助海上自卫队保护日本民众免受战争的灾祸?
18 异次元的狙击手
以635米的高度为傲、可以俯瞰东京街景的铃木塔
《异次元的狙击手》青山手绘海报(注：以现实中634米的东京晴空塔为原型)竣工。前往参加其开幕仪式的柯南等人，从眺望台上享受着绝美的景色。就在此时，一发子弹击碎了窗户玻璃，打穿了一个男人的胸膛。案件发生于一瞬之间，完全搞不清到底发生了什么，小兰与少年侦探团都陷入了恐慌。柯南立刻利用追踪眼镜的望远镜功能，沿着弹道发现了一个黑色的身影。“从那么远的距离进行狙击，怎么可能?!”柯南马上与女高中生侦探世良真纯乘坐摩托车追赶逃走的狙击手，意想不到的是狙击手居然连警察的巡逻车都打算一起炸掉，整个追踪过程都被其玩弄于股掌之中。结果，这场激烈的追踪将FBI也卷入其中，犯人以及狙击事件的谜团都消失在了大海里。于是柯南和世良协力，而警察和FBI合作调查此案，终于查出了美国海军特种部队“海豹突击队(Navy Seals)”的存在。其实这起狙击事件不过是接下来将发生的大混乱的第一步!与此同时，住在工藤新一家的神秘研究生冲矢昴也不动声色地秘密行动起来……
19 业火的向日葵
纽约的奇迹!大富豪来到日本?大富豪云集的拍卖会场人声鼎沸。铃木财团的顾问铃木次郎吉拍下了据说早已在日本被烧毁的梵高名作《向日葵》。电视正对这个重大新闻进行全球直播，柯南和小兰他们也在目不转睛地收看着。为保护画作，铃木财团召集了以毛利小五郎为首的专业团队“七武士”。就在这时，怪盗基德突然出现!他大张旗鼓地扰乱了会场，随后消失在纽约上空。嫌疑犯怪盗基德?!此后载着《向日葵》的客机在飞往日本的途中突然爆炸!《向日葵》最终被潜伏在机上的基德夺走。飞机紧急迫降在羽田机场，柯南赶到并成功夺回了《向日葵》，然而让他深感不解的是，“向来只对大型宝石下手的基德，怎么会沦为不惜伤人性命的嫌犯?”不久，灰原去新宿的美术馆参观，没想到基德居然大胆地出现在那里!媒体也被卷入其中，现场一片混乱。其手法，神出鬼没——巧妙的犯罪手法一步步升级之时，《向日葵》被安放在了雷克洛克美术馆。那里号称有着坚不可摧的保安系统。铃木次郎吉的目的是集齐世上现存的7幅《向日葵》，举办一场史无前例的画展。这些极具历史意义的画作万一发生意外，极可能引发国际争端，在这样紧迫的状况下，纽约市警方也携手合作，还有柯南和“七武士”负责戒备。此时，小五郎收到了基德发出的神秘预告函!演员齐聚，狂宴开幕!!基德的阴影不断逼近。另一方面，各幅《向日葵》也陆续从世界各国汇集到日本。终于到了画展开幕的这天，在宣告开幕的乐声中，高中生侦探工藤新一悄然现身!
